Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39aA2ACP1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms