Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms