Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms