Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms