Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer3W4VSP1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms