Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms