Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc166S4R181 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms