Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms