Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms