Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms