Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms