Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rspo1Q9Z132 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rspo1Q9Z132 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms