Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms