Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec2Q9WV35 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms