Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms