Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms