Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn4Q9WU22 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms