Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms