Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms