Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt71Q9R0H5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms