Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms