Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Col4a3Q9QZS0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms