Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms