Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms