Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn8Q9QZ49 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms