Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms