Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms