Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms