Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms