Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms