Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rfx5Q9JL61 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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