Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Mrpl39Q9JKF7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl39Q9JKF7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl39Q9JKF7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl39Q9JKF7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mrpl39Q9JKF7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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