Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms