Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms