Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms