Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms