Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp29Q9ES63 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp29Q9ES63 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp29Q9ES63 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms