Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms