Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms