Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med27Q9DB40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms