Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms