Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms