Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700016D06RikQ9DAA5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms