Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms