Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem239Q9DA47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms