Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms