Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc70Q9D9B0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms