Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms