Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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