Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms